立式高壓滅菌鍋采用濕熱滅菌法，在同樣的溫度下，濕熱的殺菌效果比干熱滅菌效果好很多，原因有以下幾點：
1、蛋白質凝固所需要的溫度與其含水量有很大關系，含水量越大，發生凝固所需要的溫度就越低。濕熱滅菌時菌體蛋白質可以吸收水分，所以比在同一溫度下的干熱空氣中更容易凝固。
2、濕熱滅菌過程中蒸汽會放出大量潛熱，從而進一步提高溫度，減少滅菌時間，在同一溫度下，濕熱滅菌所需時間比干熱短。
3、濕熱氣體的穿透力比干熱氣體強，故濕熱比干熱收效好。高壓蒸汽可以殺死一切微生物，甚至包括細菌的芽孢，真菌的孢子等耐高溫的個體。滅菌的蒸汽溫度隨蒸汽壓力增加而升高，通過增加蒸汽壓力，滅菌時間可被大大縮短。因此它是一種較有效，使用較廣泛的滅菌方法。
蒸汽排放的兩種方式：
蒸汽向上排放：這是一種傳統的蒸汽排放方式，滅菌器底部加水，加熱元件在底部，加熱后蒸汽從下向上充滿滅菌室并排空空氣，但是在加熱過程中，由于空氣重力大，所以空氣會下沉到底部，從而很難完全排放空氣。
蒸汽向下排放：通過獨立蒸汽發生器產生蒸汽。這種方式蒸汽從上部注入，滅菌腔體內沒有加熱絲，蒸汽從上向下排放空氣，空氣從底部排出。通過多次通入蒸汽，這種方式可以保證空氣被排放。
